Czasopismo stwarza Autorom wywodzącym się z różnych kręgów dyscyplin nauki i techniki, możliwość prezentowania rozwiązań geoinformatycznych, a Czytelnikom - poznawania bardzo różnych zastosowań informatyki (m. in. metod rozpoznawania obrazów, sieci neuronowych, systemów eksperckich, hurtowni danych) w szerokim spektrum nauk o Ziemi.
Misją czasopisma jest zatem upowszechnianie badań geoinformatycznych, zarówno teoretycznych, jak i praktycznych, a także zapoznawanie czytelników z bieżącymi osiągnięciami międzynarodowymi w tym obszarze. Ważnym celem Geoinformatica Polonica jest także współpraca, integracja i rozwój środowiska naukowego na wszystkich polach: badawczym, konceptualnym i organizacyjnym.