W Peregrinus Cracoviensis publikowane są artykuły oraz recenzje obejmujące zagadnienia z zakresu:
- Geografii religii:
- geografia religii jako dyscyplina nauk geograficznych,
- regionalizacja zjawisk religijnych,
- rozwój przestrzenny religii,
- przestrzeń sakralna,
- krajobraz sakralny i religijny,
- główne religie świata,
- religie i wyznania w Polsce,
- religia a polityka,
- osadnictwo a funkcja religijna,
- wpływ religii na rozwój różnych dziedzin gospodarki,
- środowisko geograficzne a religia,
- religia a ochrona środowiska,
- geografia Ziemi Świętej,
- kartografia religijna.
- Pielgrzymki i turystyka religijna:
- pielgrzymki i migracje religijne,
- religia a turystyka („turystyka religijna"),
- centra pielgrzymkowe świata,
- sanktuaria i pielgrzymki w Polsce.