Alfellani M. A., Taner-Mulla D., Jacob A. S., Imeede C. A., Yoshikawa H., Stensvold C. R., Clark C. G. (2013) Genetic diversity of Blastocystis in livestock and zoo animals. Protist 164: 497–509
Amiet J.-L., Affa’a F.-M. (1985) A propos des strategies d’infestation chez les protozoaires parasites ou endocommensaux des amphibiens anoures du Cameroun. Rev. Ecol. (Terre Vie). 40: 389–398
Capella-Gutierrez S., Silla-Martinez J. M., Gabaldon T. (2009) trimAl: a tool for automated alignment trimming in large-scale phylogenetic analyses. Bioinformatics 25: 1972–1973
Delvinquier B. L. J., Desser S. S. (1996) Opalinidae (Sarcomastigophora) in North American Amphibia. Genus Opalina Purkinje and Valentin, 1835. Syst. Parasitol. 33: 33–51
Delvinquier B. L. J., Patterson D. J. (1993) The Opalines. In: Kreier, J. P., Baker, J. R. (Eds), Parasitic Protozoa. Academic Press, San Diego, pp: 247–325
Delvinquier B. L. J., Markus M. B., Passmore N. I. (1991a) Opalinidae in African Anura I. Genus Opalina. Syst. Parasitol. 19: 119–146
Delvinquier B. L. J., Markus M. B., Passmore N. I. (1991b) Opalinidae in African Anura II. Genera Protozelleriella n. g. and Zelleriella. Syst. Parasitol. 19: 159–185
Delvinquier B. L. J., Markus M. B., Passmore N. I. (1992) Opalinidae in African Anura III. Genus Cepedea. Syst. Parasitol. 24: 53–80
Delvinquier B. L. J., Markus M. B., Passmore N. I. (1995) Opalinidae in African Anura IV. Genus Protoopalina. Syst. Parasitol. 30: 81–120
Evans K. M., Wortley A. H., Simpson G. E., Chepurnov V. A., Man D. G. (2008) A molecular systematic approach to explore diversity within the Sellaphora pupula species complex (Bacillariophyta). J. Phycol. 
Finlay B. J., Esteban G. F., Brown S., Fenchel T., Hoef-Emden K. (2006) Multiple cosmopolitan ecotypes within a microbial eukaryote morphospecies. Protist. 157: 377–390
Gentekaki E., Lynn D. H. (2010) Evidence for cryptic speciation in Carchesium polypinum Linnaeus, 1758 (Ciliophora: Peritrichia) inferred from mitochondrial, nuclear and morphological markers. J. Eukaryot. Microbiol. 57: 508–519
Katoh K., Misawa K., Kuma K. I., Miyata T. (2002) MAFFT: a novel method for rapid multiple sequence alignment based on fast Fourier transform. Nucleic Acids Res. 30: 3059–3066
Katz L. A., de Berardinis J., Hall M. S., Kovner A. M., Dunthorn M., Muse S. V. (2011) Heterogeneous rates of molecular evolution among cryptic species of the ciliate morphospecies Chilodonella uncinata. J. Mol. Evol. 
Kimura M. (1980) A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J. Mol. Evol. 16: 111–120
Kostka M., Hampl V., Cepicka I., Flegr J. (2004) Phylogenetic position of Protoopalina intestinalis based on SSU rRNA gene sequence. Mol. Phylogenet. Evol. 33: 220–224
Lahr D. J. G., Laughinghouse H. D., Oliverio A. M., Gao F., Katz L. A. (2014) How discordant morphological and molecular evolution among microorganisms can revise our notions of biodiversity on Earth. Bioessays 36: 950–959
Maslov D. A., Votypka J., Yurchenko V., Lukes J. (2013) Diversity and phylogeny of insect trypanosomatids: all that is hidden shall be revealed. Trends Parasitol. 29: 43–52
McCallum F., Maden B. E. H. (1985) Human 18S ribosomal RNA sequence inferred from DNA sequence. Biochem. J. 232: 725–733
Medlin L., Elwood H. J., Stickel S., Sogin M. L. (1988) The characterization of enzymatically amplified eukaryotic 16S-like rRNA-coding regions. Gene 71: 491–499
Miller M. A., Pfeiffer W., Schwartz T. (2010) “Creating the CIPRES science gateway for inference of large phylogenetic trees” in proceedings of the Gateway Computing Environments Workshop (GCE), New Orleans, LA pp: 1–8
Mohammad K. N., Badrul M. M., Mohamad N., Zainal-Abidin A. H. (2013) Protozoan parasites of four species of wild anurans from a local zoo in Malaysia. Trop. Biomed. 30: 615–620
Nishi A., Ishida K., Endoh H. (2005) Reevaluation of the evolutionary position of opalinids based on 18S rDNA and α- and β-tubulin gene phylogenies. J. Mol. Evol. 60: 695–705
Ronquist F., Huelsenbeck J. P. (2003) MrBayes3, Bayesian inference under mixed models. Bioinformatics 19: 1572–1574
Saez A. G., Probert I., Geisen M., Quinn P., Young J. R., Medlin L. K. (2003). Pseudo-cryptic speciation in coccolithophores. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 7163–7168
Sanchez R., Serra F., Tarraga J., Medina I, Carbonell J., Pulido L., de Maria A., Capella-Gutierrez S., Huerta-Cepas J., Gabaldon T., Dopazo J., Dopazo H. (2011) Phylemon 2.0: a suite of web-tools for molecular evolution, phylogenetics, phylogenomics and hypotheses testing. Nucleic Acids Res. 39: W470–W474
Stamatakis A. (2006) RAxML-VI-HPC: maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models. Bioinformatics 22: 2688–2690
Stensvold C. R., Alfellani M., Clark G. C. (2012) Levels of genetic diversity vary dramatically between Blastocystis subtypes. Infect. Genet. Evol. 12: 263–273
Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. (2011) MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 28: 2731–2739
Yang W. C. T. (1960) On the continuous culture of opalinids. J. Parasitol. 46: 32
Yurchenko V., Lukes J., Tesarova M., Jirku M., Maslov D. A. (2008) Morphological discordance of the new trypanosomatid species phylogenetically associated with the genus Crithidia. Protist 159: 99–114