@article{018e9e3b-b790-722a-b136-ee41f3f4fd63,
author = {Karolina  Hołub, Boris A. Malyarchuk, Miroslava V. Derenko, Nataša  Kovačević-Grujičić, Milena  Stevanović, Danijela  Drakulić, Slobodan  Davidović, Tomasz  Grzybowski},
title = {Weryfikacja markerów insercyjno-delecyjnych (InDels) i mikrosatelitarnych (STR) jako narzędzi pomocniczych do wnioskowania o pochodzeniu populacji słowiańskiej},
journal = {Archiwum Medycyny Sądowej i Kryminologii},
volume = {2022},
number = {Vol. 72 (3)},
year = {2023},
issn = {0324-8267},
pages = {120-137},keywords = {polimorfizm insercyjno-delecyjny; mikrosatelity; Słowianie},
abstract = {Markery genetyczne do przewidywania pochodzenia biogeograficznego od wielu lat okazują się skutecznymi narzędziami dla organów ścigania. W tym badaniu podjęliśmy próbę oceny potencjału markerów insercyjno-delecyjnych (InDel) i mikrosatelitarnych (STR) jako pomocniczych polimorfizmów do wnioskowania o pochodzeniu populacji słowiańskiej. W tym celu genotypowaliśmy próbki populacji słowiańskojęzycznych z Białorusi, Czech, Polski, Serbii, Ukrainy i Rosji w w zakresie 46 markerów InDel oraz 15 loci STR za pomocą PCR i elektroforezy kapilarnej oraz analizowaliśmy pod kątem różnicowania między populacjami za pomocą metod bazujących na dystansach genetycznych (FST, analiza głównych składowych i skalowanie wielowymiarowe). Dodatkowo zbadaliśmy próbkę mężczyzny z populacji polskiej o dobrze udokumentowanej genealogii, którego pochodzenie biogeograficzne zostało wcześniej ustalone przez komercyjne usługi genomiczne przy użyciu autosomalnych polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP), mitochondrialnego DNA i markerów Y-SNP. Do celów porównawczych wykorzystaliśmy dane genotypowe zebrane w przeglądarce „forInDel” i częstości alleli z wcześniej opublikowanych artykułów. Uzyskane wyniki dla InDels i STR wskazują, że populacje słowiańskie stanowią grupę genetycznie jednorodną, z wyjątkiem Czechów wyraźnie różniących się od pozostałych badanych populacji. Analiza znanej polskiej próbki w aplikacji Snipper dowodzi przydatności markerów InDel jedynie na poziomie kontynentalnym. Z kolei, mikrosatelity nie tylko poprawiają wyniki predykcji, ale są informatywne jako niezależny zestaw markerów pochodzenia biogeograficznego.},
doi = {10.4467/16891716AMSIK.22.015.17393},
url = {https://ejournals.eu/czasopismo/amsik/artykul/verification-of-insertion-deletion-markers-indels-and-microsatellites-strs-as-subsidiary-tools-for-inferring-slavic-population-ancestry}
}